Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp1Q8BJQ2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms