Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms