Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zbtb40Q6PCS8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Zbtb40Q6PCS8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Zbtb40Q6PCS8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbtb40Q6PCS8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms