Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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