Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nckap5lQ6GQX2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms