Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Pkp4Q68FH0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 916.9 ms