Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnna3Q65CL1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms