Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sdc3Q64519 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms