Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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