Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Sall3Q62255 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Sall3Q62255 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Sall3Q62255 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms