Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trp53i11Q4QQM4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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