Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms