Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms