Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Lemd1Q14C37 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Lemd1Q14C37 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Lemd1Q14C37 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Lemd1Q14C37 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Lemd1Q14C37 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Lemd1Q14C37 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Lemd1Q14C37 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lemd1Q14C37 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Lemd1Q14C37 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms