Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms