Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pate4Q09098 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms