Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Siah2Q06986 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms