Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Siah1bQ06985 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms