Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NfiaQ02780 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NfiaQ02780 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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NfiaQ02780 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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NfiaQ02780 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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