Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb4Q02738 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms