Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms