Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms