Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeleQ00690 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms