Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mesp1P97309 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms