Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms