Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms