Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms