Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp4P59240 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms