Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P58686 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P58686 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms