Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms