Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TesP47226 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TesP47226 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TesP47226 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TesP47226 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TesP47226 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TesP47226 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms