Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sftpa1P35242 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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