Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms