Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pde6aP27664 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pde6aP27664 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Pde6aP27664 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde6aP27664 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Pde6aP27664 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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