Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tln1P26039 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tln1P26039 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms