Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms