Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SftpcP21841 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SftpcP21841 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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SftpcP21841 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms