Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms