Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna9P09235 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms