Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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