Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms