Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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