Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Colca2F8VPY8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms