Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6482F6YHC1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms