Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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