Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ckap5A2AGT5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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