Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sema6cQ9WTM3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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