Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms