Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ap4m1Q9JKC7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ap4m1Q9JKC7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms