Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms